整地施肥
地要整平，整细，并结合整地施肥，以杀死有机肥中的病菌。施有机肥，如鸡粪、猪粪、牛粪等，或利用植物秸秆如玉米秆、稻草(切成3～5厘米长小段)，如果加入植物秸秆的话，每亩相应增施15~20公斤尿素，因为秸秆在腐熟分解的过程中需要消耗~定量的氮素，有机肥亩用量~般3000～5000公斤。均匀撒施在土壤表面，然后深翻25～30厘米。有机肥如鸡粪、干牛粪等，有提高地温和维持地温的作用，使杀菌效果更好。地整好后，再按照作物的种植方式起垄或做成高低畦，这样可使地膜与地面之间形成~个小空间，有利于提高地温。
灌水
大棚四周做坝，灌水，水面最好高出地面3～5厘米，有条件的覆盖旧薄膜，要关好大棚风口，盖好大棚膜，防止雨水进入，严格保持大棚的密闭性，使地表以下10厘米温度达到70℃以上，20厘米地温达到45℃以上，达到灭菌杀虫的效果。土壤的含水量与杀菌效果密切相关，如果土壤含水量过高，对于提高地温不利；土壤含水量过低，又达不到较好的杀菌效果。实践证明，土壤含水量达到田间持水量的60%~65%时效果最好。
药物处理
用氯化苦进行地膜覆盖土壤消毒，以杀死土壤中的病菌。方法是把氯化苦注到畦内，50平方厘米挖一穴，深度10～15厘米，每穴4毫升。每亩用药约25~30公斤。此外，在密闭大棚之前，棚体内表面喷施1遍杀菌药和杀虫剂，以杀死躲在墙缝中的病菌和害虫。
氯化苦主要应用于土壤熏蒸，防治真菌、细菌、线虫等土传病害，对杂草、地下害虫也有~定的防治效果，一般于作物定植前30天左右施药，其使用方法是田地深翻清除残渣后，用专门的土壤注射设备向地下注射氯化苦液剂，深度为15厘米，然后立即覆盖地膜，密闭熏蒸，一般熏蒸15天左右（依温度而定，温度高时间可缩短，温度低适当延长），再揭开地膜翻耕，待药液全部挥发后定植。
氯化苦液剂土壤熏蒸对土壤有一定的选择性，避免选择土质较粘通透性较差的田地，避免选择下坡和低洼处田地；氯化苦施药土壤适宜湿度55%~65%，避免太涝，以免产生药害，施药避开雨季；适宜土壤温度15℃~20℃，温度过低施药效果不佳。同时避免相邻地有处于生长期作物，远离牲畜、家禽、家蚕养殖地，远离水产养殖区使用。禁止在河塘等水体中清洗施药器具，药剂包装需统~回收处理。
密闭大棚
用大棚膜和地膜进行双层覆盖，周遭一定要用土压严压实，严格保持大棚的密闭性，防治薄膜破损泄露热气和温度，以免降低熏蒸效果(为了验证膜下温度，也可以在双膜下当一个空矿泉水瓶子)。在这样的条件下处理，地表下10厘米处土壤最高地温可达70℃~75℃，20厘米的地温可达45℃以上，这样高的地温杀菌率可达80%以上，同时这样的高温足以把以前放置的矿泉水瓶子晒得皱缩为一团。
消毒时间
绝大多数病菌不耐高温，经过很短时间的热处理（一般为10天左右）即可被杀死，如一些立枯病病菌、黄瓜的菌核病病菌、黄瓜疫病病菌、茄子黄萎病病菌等。但是也有的病菌特别耐高温，如根腐病病菌、根肿病病菌和枯萎病病菌等一些深根性土传染菌，由于其分布的土层深，必须处理30～50天才能达到较好效果。因此，进行土壤消毒时，不但要结合不同的作物进行不同程度地土壤深翻，而且还应根据棚内所种作物及其相应病菌的抗热能力来确定消毒时间的长短。
